จีโนมหลักคือชุดของยีนที่พบในทุกสายพันธุ์ของเชื้อโรค จีโนมแพนเป็นกลุ่มยีนทั้งหมดสำหรับสายพันธุ์ของเชื้อโรคนั้น ๆ และรวมถึงยีนที่ไม่ได้ใช้ร่วมกันในทุกสายพันธุ์ Pan-genomes อาจเปิดหรือปิดขึ้นอยู่กับว่าการตรวจสอบเปรียบเทียบของหลายสายพันธุ์พบว่าไม่มียีนใหม่ (ปิด) หรือยีนใหม่จำนวนมาก (เปิด) เมื่อเทียบกับจีโนมหลักของสายพันธุ์ที่ก่อโรคนั้น ในจีโนมแพนเปิดยีนอาจมีลักษณะเฉพาะในลักษณะที่จ่ายได้หรือเฉพาะสายพันธุ์ ยีนที่จ่ายได้คือยีนที่พบในสายพันธุ์มากกว่าหนึ่งสายพันธุ์ แต่ไม่ใช่ในทุกสายพันธุ์ของเชื้อโรค ยีนเฉพาะของสายพันธุ์คือยีนที่พบในสายพันธุ์ของเชื้อโรคเท่านั้น ความแตกต่างของจีโนมแพนคือการสะท้อนรูปแบบชีวิตของสิ่งมีชีวิต เช่น Streptococcus agalactiae ซึ่งมีอยู่ในซอกที่มีความหลากหลายทางชีวภาพที่มีความกว้างกระทะจีโนมเมื่อเทียบกับที่แยกกับสิ่งแวดล้อมมากขึ้น Bacillus anthracis วิธีการเปรียบเทียบจีโนมนอกจากจะใช้เพื่อทำความเข้าใจเพิ่มเติมโดยอ้างอิงถึงจีโนมแพน การค้นพบล่าสุดแสดงให้เห็นว่าจำนวนของสิ่งมีชีวิตชนิดใหม่ยังคงเติบโตต่อไปโดยมีแบคทีเรียประมาณ 10 31ชนิดบนโลกใบนี้โดยที่แบคทีเรียเหล่านี้ติดเชื้อ 10 24 ตัวต่อวินาทีการแลกเปลี่ยนสารพันธุกรรมอย่างต่อเนื่องเป็นเรื่องยากที่จะจินตนาการได้
ภาพ 385A | ภาพรวมของแพนจีโนม | Amcrisan / Attribution 3.0 Unported | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Pan-genome-graphics.png) จาก Wikimedia Commons
ผู้เขียน : Merim Kumars
การอ้างอิง:
จุลชีววิทยาทางการแพทย์ที่สอง: การทำหมันการวินิจฉัยในห้องปฏิบัติการและการตอบสนองทางภูมิคุ้มกัน
ความคิดเห็น
แสดงความคิดเห็น