ในการปรับเทคนิค footprinting ให้เข้ากับวิธีการตรวจจับที่อัปเดตชิ้นส่วน DNA ที่มีป้ายกำกับจะถูกตรวจพบโดยแกดเจ็ตcapillary electrophoresis แทนที่จะทำงานบนโพลีอะคริลาไมด์เจล ถ้าส่วน DNA ที่จะวิเคราะห์เกิดจากปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส( PCR) การจับคู่โมเลกุลเรืองแสงตามที่แสดงโดยคาร์บอกซีฟลูออเรสซิน (FAM) กับไพรเมอร์ ด้วยวิธีนี้ชิ้นส่วนที่ผลิตโดยการย่อย DNaseI จะมี FAM และเส้นเลือดฝอยจะตรวจพบได้ electrophoresis เครื่อง โดยปกติแล้วคาร์บอกซีเตตราเมทิล - โรดามีน (ROX) - ขนาดมาตรฐานจะมีลักษณะคล้ายกับที่เติมลงในส่วนผสมของชิ้นส่วนที่จะวิเคราะห์ ระบุไซต์ที่มีผลผูกพันของปัจจัยการคัดลอกได้สำเร็จด้วยวิธีนี้
การทดสอบจีโนมแบบกว้าง ๆ
การจัดลำดับรุ่นใหม่ทำให้ผู้ที่อยู่ใกล้จีโนมสามารถเปิดเผยรอยเท้า DNA ได้ การตรวจโครมาตินแบบเปิดดังที่แสดงโดย DNase-Seq และ FAIRE-Seq ได้รับการพิสูจน์แล้วว่าให้แนวการควบคุมที่แข็งแกร่งสำหรับเซลล์หลายประเภท อย่างไรก็ตามการทดสอบเหล่านี้จำเป็นต้องมีการวิเคราะห์ข้อมูลทางชีวสารสนเทศขั้นปลายตามระเบียบเพื่อให้มีรอยเท้า DNA ทั่วทั้งจีโนมเครื่องมือคำนวณที่นำเสนอสามารถแบ่งได้เป็นสองประเภท ได้แก่ วิธีการแบ่งส่วนและวิธีการที่เน้นไซต์เป็นศูนย์กลาง
ภาพที่ 142A | รูปที่ 3 เทคนิคการพิมพ์ลายนิ้วมือของจุลินทรีย์ที่เรียกว่า (Automated) การตรวจสอบไรโบโซมอลอินเตอร์เจนิกสเปเซอร์ แผนภาพแสดงผลลัพธ์ของทั้ง Automated RISA (Pathway 1) หรือ RISA (Pathway 2) | Ilyanassa / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/legalcode) | Page URL : (https://en.wikipedia.org/wiki/File:Step-by-step_procedure_of_using_ARISA_analysis_in_microbiology.pdf) จากวิกิมีเดียคอมมอนส์
ผู้เขียน : Milos Pawlowski
ความคิดเห็น
แสดงความคิดเห็น