การจัดลำดับ SMRT ขึ้นอยู่กับการจัดลำดับโดยการสังเคราะห์อยู่ในมือ DNA ถูกสังเคราะห์ในศูนย์โหมดคลื่นไกด์ (ZMWs) - ขนาดเล็กได้ดีเหมือนภาชนะที่มีเครื่องมือจับอยู่ที่ด้านล่างของดีที่ การจัดลำดับจะดำเนินการโดยใช้โพลีเมอเรสที่ไม่ได้ปรับเปลี่ยน (ติดกับด้านล่างของ ZMW) และนิวคลีโอไทด์ที่ติดฉลากเรืองแสงซึ่งไหลอย่างอิสระในสารละลาย บ่อน้ำถูกสร้างขึ้นในลักษณะที่ตรวจพบเฉพาะการเรืองแสงที่เกิดขึ้นที่ก้นหลุมเท่านั้น ฉลากเรืองแสงถูกแยกออกจากนิวคลีโอไทด์เมื่อรวมตัวเป็นเส้นใย DNA โดยปล่อยให้ไม่มีการดัดแปลง DNA เส้นใย ตาม Pacific Biosciences (PacBio) ผู้พัฒนาเทคโนโลยี SMRT วิธีการนี้ช่วยให้สามารถตรวจจับการปรับเปลี่ยนนิวคลีโอไทด์ (เช่น cytosine methylation) สิ่งนี้เกิดขึ้นจากคำพูดของจลนศาสตร์โพลีเมอเรส สิ่งนี้อยู่ในมือช่วยให้สามารถวิเคราะห์นิวคลีโอไทด์ 20,000 นิวคลีโอไทด์ขึ้นไปโดยมีความยาวอ่านเฉลี่ย 5 กิโลเบส ในปี 2558 Pacific Biosciences ได้ประกาศเปิดตัวเครื่องมือลำดับใหม่ที่เรียกว่า Sequel System โดยมี 1 ล้าน ZMW เมื่อเทียบกับ 150, 000 ZMW ในเครื่องมือ PacBio RS II การจัดลำดับ SMRT เรียกว่าการจัดลำดับ "รุ่นที่สาม" หรือ "อ่านยาว"
ภาพ 151A | การวิเคราะห์การเรียงต่อกันที่กระจัดกระจายหลายรายการจะต้องประกอบเข้าด้วยกันบนพื้นฐานของพื้นที่ที่ทับซ้อนกัน | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) จาก Wikimedia Commons
ผู้เขียน : Milos Pawlowski
ความคิดเห็น
แสดงความคิดเห็น