ซอฟต์แวร์สำหรับชีวสารสนเทศศาสตร์และการออกแบบ

การใช้พลาสมิดเป็นเทคนิคในอณูชีววิทยาได้รับการสนับสนุนโดยซอฟต์แวร์ชีวสารสนเทศศาสตร์ โปรแกรมเหล่านี้บันทึกการเชื่อมต่อ DNA ของเวกเตอร์พลาสมิดช่วยในการทำนายตำแหน่งที่ตัดของเอนไซม์ จำกัด และวางแผนการจัดการ ตัวอย่างของชุดซอฟต์แวร์ที่จัดการแผนที่พลาสมิด ได้แก่ ApE, Clone Manager, GeneConstructionKit, Geneious, Genome Compiler, LabGenius, Lasergene, MacVector, pDraw32, Serial Cloner, VectorFriends, Vector NTI และ WebDSV ซอฟต์แวร์เหล่านี้ช่วยทำการทดลองทั้งหมดในซิลิโคก่อนทำการทดลองแบบเปียก

คอลเลกชัน Plasmid

พลาสมิดจำนวนมากถูกสร้างขึ้นในช่วงหลายปีที่ผ่านมาและนักวิจัยได้มอบพลาสมิดให้กับฐานข้อมูลพลาสมิดเช่นองค์กรไม่แสวงหาผลกำไร Addgene และ BCCM / LMBP เราสามารถระบุและชักชวนพลาสมิดจากฐานข้อมูลเหล่านั้นเพื่อการวิจัยนักวิจัยมักจะอัปโหลดลำดับพลาสมิดไปยังฐานข้อมูล NCBI ซึ่งสามารถดึงข้อมูลลำดับของพลาสมิดเฉพาะได้

Plasmidome

พลาสมิดโดมของสภาพแวดล้อมหมายถึงพลาสมิดที่มีอยู่ในนั้นคำนี้เป็นกระเป๋าพกพาของคำภาษาอังกฤษสองคำพลาสมิดและอาณาจักรในการวิจัยทางชีววิทยาพลาสมิดโดมอาจหมายถึงพลาสมิดจริงที่พบและแยกได้จากจุลินทรีย์บางชนิดโดยการเพาะเลี้ยงที่แยกได้ จุลินทรีย์และการตรวจสอบพลาสมิดที่มีอยู่หรือโดยการเก็บตัวอย่างสิ่งแวดล้อมและทำการสำรวจเชิงอภิปรัชญาโดยใช้วิธีการจัดลำดับรุ่นต่อไปในการควบคุมเพื่อระบุและกำหนดลักษณะของจีโนมพลาสมิดที่อยู่ในสภาพแวดล้อมนั้น

ภาพ 239A | การแสดงแผนผังของเวกเตอร์ pBR322 ที่มีไซต์ จำกัด ระบุเป็นสีน้ำเงิน | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

ภาพ 239A | การแสดงแผนผังของเวกเตอร์ pBR322 ที่มีไซต์ จำกัด ระบุเป็นสีน้ำเงิน | Ayacop (+ Yikrazuul) / Public domain | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:PBR322.svg) from Wikimedia Commons

ผู้เขียน : Milos Pawlowski

การอ้างอิง:

เทคนิคชีววิทยาโมเลกุล 2

เทคนิคทางอณูชีววิทยา V

ความคิดเห็น